Во время церковной службы Барт вместо гимнов раздаёт прихожанам тексты песни «In the Garden of Eden» (пародия на хит Iron Butterfly). Органистка выдерживает 17 минут, после чего падает в обморок прямо на клавиши. Преподобный Лавджой выясняет, кто устроил диверсию. Милхаус под угрозами выдаёт Барта. В наказание их обоих отправляют чистить трубы органа (Милхауса за ябедничество). Милхаус оправдывается тем, что не хотел, чтобы его душу склевали чёрные вороны. Барт заявляет, что души не существует, и в доказательство продаёт свою за пять долларов, написав на бумажке «Душа Барта Симпсона». На эти деньги он покупает губки-динозавров, которые при намокании должны вырастать. Он пытается разыграть Лизу, но губка уплывает в ливнёвку.
Лиза, узнав о сделке, объясняет брату, что душа символ всего лучшего в человеке, и Милхаус теперь навеки стал его «владельцем». Барт не верит, но вскоре с ним происходят странные вещи. С ним отказывается играть Маленький помощник Санты, не открываются автоматические двери в магазине, нет конденсата на стекле, и он не может смеяться над «Щекоткой и Царапкой». Лиза ставит эксперимент: они прячутся в шкафу, а она кладёт скейтборд на пути Гомера. Когда Гомер застревает в перилах, Лиза смеётся, а Барт нет. Он понимает, что действительно потерял душу.
Тем временем Мо, увидев, как семья Хибберта уходит из его таверны, решает превратить заведение в семейный ресторан «Кафе у дядюшки Мо». Идея приносит доход, но накопленный стресс приводит к тому, что Мо срывается на маленькую девочку, и клиенты уходят. Он возвращает таверну в прежнее состояние.
Барт пытается выкупить душу у Милхауса, но тот требует уже 50 долларов. Ночью Барту снится, что он единственный ребёнок без души. Он отправляется к дому Милхауса, но там фумигация, и семья уехала к бабушке. Догнав Милхауса, Барт узнаёт, что тот обменял его душу у Продавца Комиксов на значки с Альфом. Барт ночует у магазина, а утром продавец отказывается говорить, кому продал душу. Барт идёт домой под дождём, молится в своей комнате, и вдруг на кровать падает листок «Душа Барта Симпсона». Оказывается, его выкупила Лиза. Пока она рассуждает о философии, Барт счастливо съедает бумажку и видит сон о том, что у него есть душа.
